香港中西醫學協會採用理事會領導、秘書處執行、專業委員會協辦的現代化社團管理體系，架構層級清晰、職能明確，保障協會學術發展、會員服務、認證管理及對外交流工作規範有序運行。

一、最高決策機構：理事會

理事會為協會最高權力與決策機構，統籌協會整體發展戰略、管理制度、年度工作規劃、對外合作及重大事務審議。

• 會長 1名｜統領全局，對外代表協會

• 常務副會長 2名｜協助會長分管日常運營與學術建設

• 副會長 4名｜分管對外交流、會員發展、公益服務、資格認證

• 常務理事｜負責重大事務審議與制度監督

• 理事｜參與年度會議、參與學術建設與行業共建

二、監督機構：監事會

監事會獨立行使監督職權，負責審核協會財務運作、制度執行、活動規範及會員權益保障工作，確保協會運作公開、公正、透明。

• 監事長 1名

• 監事若干名

三、常設執行機構：秘書處

秘書處為協會日常常設執行部門，統一執行理事會決議，負責全站日常運營、文書檔案、會員管理、活動組織、對接諮詢與證書存檔查詢工作。

• 秘書長｜主持秘書處全面工作

• 行政事務組｜文書、檔案、日常行政、網站維護

• 會員服務組｜入會諮詢、資格審核、會員檔案管理

• 對外聯絡組｜海內外機構交流、合作對接、活動接待

四、專業學術委員會（核心業務部門）

各專業委員會由資深醫學專家、學者、臨床醫師組成，負責學術研究、技術標準制定、專業培訓及專家評審工作。

• 中西醫整合學術委員會：主導學術研討、課題交流、學術成果整理

• 臨床醫療專業委員會：規範臨床應用標準、技術交流與案例評審

• 醫學教育與培訓委員會：負責專業課程、持續教育、行業培訓體系建設

• 資格評審與認證委員會：負責從業資格審核、證書認證、檔案核驗工作

• 公共健康與科普委員會：開展健康科普、公益講座、社會醫療服務

五、基層服務體系：會員中心

負責個人會員、單位會員的招募、歸檔、服務跟進、權益維護，搭建團結、規範、專業的醫療從業人員交流平台。